QRコードのセル数を少なくするために（つまり、印刷されたときの1つのセルを大きくするために）Versionはできるだけ小さく、また、くっきりと印刷するためにSizeは大きめに設定すると良いようです。
ちなみに、合成したQRコードを家庭用プリンタで縦横4cm弱で印刷しましたが、Versionを10に設定した場合はときどきしか認識に成功しませんでした。そこで、Versionを4に設定したところ、認識率が大分改善しました。